随后清兵将哥萨克人的据点分割包围，然后集中力量逐一拔除。在经过了前后近三年时间的苦战，先后付出了超过五万人的死伤代价后，清兵成功的收复了雅克萨、尼布楚两处要点和十余处小据点，重新恢复了对整个黑龙江流域的控制，解救了两万多被罗刹人裹挟的民众，并把残余的三千多名哥萨克人，给统统赶进了北海湖畔的巴尔古津要塞，并重重围困起来，准备等对方的物资耗尽时予以消灭。
在剿灭罗刹匪徒之时，周培公也建言巴泰，采用了假途灭虢之计，顺带彻底将整个漠北蒙古三大部落全部降服。要说这三大部落里，其中东部的车臣汗地盘最为肥沃，水草最为丰盛，然而由于和漠南各部接壤，彼此的纷争较多，因此其手下部众反而最少，所以实力偏弱。该部又正面被被罗刹人入侵，对方在领地上搅和之后，使得他们的实力进一步是大损，因此在清兵主力到来之后，立刻就献上了贡品和归顺表奏，就此彻底效顺大清。
土谢图汗居于蒙古高原中部，部下人数众多，实力在三家里面最强，不过他的地盘也被俄罗斯人入侵，而且入侵的敌人不少，因此被打得最惨，之前已经损失了不少的精兵。面对数万气势汹汹的清兵，他只好献上贡品，同时为了表示归附的决心，还痛下杀手，献上了此前收纳的布尔尼王子的首级，以示自家诚意。有了这样有分量的东西，巴泰欣然接受了他的降表，着意安抚了一番。
而随着东部两汗归顺，西段的扎萨克图汗也无奈迅速献上了降表，还有上万匹战马和牛羊，虽然有北方的群山为遮挡，他的地盘基本没有受到罗刹人的攻击，不过夹在罗刹人和大清之间，同时近邻葛尔丹也迅速崛起，再想偏安一隅已经是不可能了，既然现在清廷大军来到，他必须做出选择，最终也归顺了清廷。为了表示自家的忠心，他不但献上了十名美女，还主动答应会派出万名部落勇士，帮助朝廷大军来对付罗刹人，让巴泰甚为满意，算是顺利过关。
随着漠北蒙古三大汗王正式归顺大清，此后附近其余的各小部落也纷纷归降清廷，其中包括盘踞在哈密吐鲁番一带的各个部落，并且大多派兵前来助阵，这样巴泰手里最终就多出了三万多的精骑，经过整编之后加入到了作战行列，得以进一步保持对罗刹人的绝对优势兵力，当然这些都是后话了。
眼下我们还是把目光再转向南方的战场。再说沐王府三路大军会攻赣州，从南康、信丰、于都三个方向展开进攻，清兵在连续失利后不久，后续的几万军马连忙赶来进行救援，很快的时间里，赣州城附近就再度集结起了超过十万的清兵，兵力再度雄厚起来。
这其中以定南大将军希尔根为主将，率领三万精锐守护赣州；都统莽依图领三万大军镇守南康，防守西面的沐剑声；总兵桑格领两万多人进驻信丰县，汇合这里的几千败兵，应对钱易部的进攻；另外的金光祖佟养钜和陈洪明等部两万余人，则驻守于都县城，汇合此地守将赵赖部近万人，迎击刘国轩大军。
虽然沐王府一方占据火器优势，然而崎岖复杂的地形，加上逐渐多雨的气候，极大的限制他们的发挥，经过近月时间的猛攻，三路明军也只能各自小有进展。其中沐剑声的西路军从黄龙村一线，推进到南康城西十里的浮石山隘口；钱易部进抵铁石口，距离信丰县城还有五六十里路程；而刘国轩部则抵达朱田村附近的隘口扎营，距离于都城还有五十里路程，短期内难以建功。
由于此时已进入雨季，大雨频频到来，山洪不断发生，冲毁道路，阻断交通，眼看攻击效果有限，同时行军艰难，运输困难，己方的优势也被彻底限制，同时弹药告急，于是沐剑声只好下令各路暂时停止进攻，转而固守现有阵地，逐步恢复兵力，消化消化俘虏和地盘，准备等雨季结束之后再行攻击。
而且经过了一个月的连续作战，明军也已经稍显疲惫，借助雨季进行适当的整休，总结一下作战经验，也是一件好事，所以就算沐剑声心里很着急，也必须这么做。