在新归顺的盘龙岛及附近各大岛，也将驻守三个地方团的守军，编为盘龙独立旅，旅长为李桂，三个团长分别为赵虎、方大壮、鹿少风，合计兵力八千余人。为了稳固防守，此前沐剑声下令，以三宝颜为核心防护区域，用水泥修筑了一些坚固的防御工事，派有一团驻军队驻守；盘龙岛东侧各城分别驻守一营的部队，而附近各个重要岛屿共有一团士兵分别驻守，这样再加上附近的水师支援，整个的防守体系几乎没有什么破绽。
若是加上吕宋大岛方面守军和水师，共有近三万多人，数量比北征大陆以前，减少了近四千人，但是由于要塞建成，而且水师战力的大幅度提升，士兵的武器也大多重新装备，土著各部落也大多已经归心，所以整个群岛的防御力反而得到了加强。
可以说，如果没有十万人以上规模的正规部队，根本就无法击败这样的一支队伍，进而攻占吕宋。只是以当今的航海条件，想要一次性运送这样一支庞大的队伍进行跨海远征，无异痴人说梦，无论是英法荷兰西班牙葡萄牙人，都做不到。
在陆军方面，目前在琼州的守军统称为新编陆军第二师，师长为赵京，副师长刘富贵，参谋长为施世骠，下辖两个老兵团和三个新兵团，团长分别为沐勇、葛小峰、武秋玄（吕宋武家）、穆聪（李定国余部子弟）、耿二胆，人员共计一万三千余人，再加上三千人的水师，共计人员一万六千余人，基本维持原有规模。
虽然琼州岛上的军力不是很多，不过考虑到他们综合的战斗力，如果没有五万以上的队伍来攻打，根本无法威胁的琼州岛的安全，也许惟有紧邻的安南国，能够有这个实力。不过随着几年前的双方冲突，安南的水师被沐王府水军给打趴下之后，对方海防已经形同虚设，更别提什么跨海作战的可能性，而岛上内部的黎苗各部也能够服从王府的领导，所以琼州岛自然就高枕无忧。
而台湾岛因为独处海外，且位于王府各方地盘的中间，仅仅与琉球国隔海相望，其安全性比较有保障，所以驻守部队统编为一个地方守备旅，旅长为沐雷，眼下辖有守军三个地方守备团，团长分别为丛淮安、陈加远（吕宋陈家骨干）、宋海洋（琼州宋家骨干），分别驻守岛屿的南北两端和中部平原，人员共七千出头，他们的主要任务还是针对岛上的高山族人，防止对方的突袭。此外王府在澎湖湾驻守有一支千余人的小型船队，负责联通海峡两岸。
目前王府在广东的守军，采用了重点防御的策略，兵力主要集中在广州、廉州、韶州、连州、清远、肇庆、梅州等十余处战略要点，其中又以广州、清远、肇庆、韶州、河源五城为支撑要点，每处有兵万人左右，再加上各处县城的守军，共计有兵近十万人，外加珠江水师的配合，协同防御各处核心要点。
这其中广州城作为临时陪都，自然是重中之重，守军为首都警备师，师长由白寒松兼任，下辖三个主力团，团长分别为李栎、韩江南、傅大海，分别驻守在城区、白云山、萝岗，外加一个炮兵营，兵力合计一万余人，这些人员再加上部分水师，以及犀利完备的城防力量，已经足够保护广州城的安全。
此外肇庆为粤西重镇，主要负责应对吴三桂一方，虽然双方目前关系已经缓和，不过防人之心不可无嘛，所以驻守的部队为新编陆军第四师，师长是沐龙，参谋长栾小川，下辖三个主力团，团长分别为李槐、李民（琼州李家骨干）、沐忠（沐剑声义子），每团近三千多人，兵力合计九千余人，再加上附近各县驻军，有超过万五之数，足够应对防御突发的进攻。