先期部队到达爪哇之后，将会有8-10天的独立作战期，因此弹药基数必须配足，罗岳要求步枪至少要配备10-12个基数的弹药、机枪要配备8-10个基数的弹药、而掷弹简、迫击炮要配备6-8个基数的弹药，手榴弹要配备4个基数，另外考虑到南洋的气候炎热，而且空气的湿度大，含盐量，腐蚀性强，武器的损耗较大，还要考虑多配备一些更换的零配件。而到达南洋之后，罗岳认为应在沿海岸15-20公里内建立滩头阵地，以及收容营，因为在这个距离内，可以受到昆明舰舰炮的保护，因此一面收纳华人，一面屯积物资，保证后续的部队到达上岸。
罗岳的计划在当天下午就报到了军委，很快就得到了军委的批备：步枪配12个基数弹药；机枪配8个基数弹药；掷弹简、60迫击炮配8个基数弹药，82迫击炮、100迫击炮配6个基数弹药，手榴弹配4个基数，另外还额外配备300支01式步枪、500支96式手枪，一方面是供二营更换使用；另一方面也是到了爪哇之后，可以在适当的时候，发展当地的武装力量，做为人民军的补充，同时也是培养华东政府在南洋的武装力量。
当然军委考虑的要比罗岳更细一步，同时还考虑人员的饮食，和随舰的医务人员、医药用品等。虽然张振勋承诺可以在沿途港口供应食物、饮水，并且在爪哇还可以提供药品，但华东政府不可能将所有的希望都放在张振勋的身上，由其是先头部队更是要做好充份的准备工作，因此组织了一个15人的医务队，其中有6名是穿越者的医务人员，随先头部队出发，同时食物和饮用水也都加量携带。好在是昆明舰的容纳空间较大，也足以装载下这些物品。
而先期部队到达爪哇之后，军委认为不必拘守沿海岸15-20公里的范围，而是应该视爪哇的情况而定，如果张振勋能够给人民军提供较大的帮助，给军舰提供舶位的码头，并让人民军迅速获得当地华人的信任，那么可以考虑在更进一步的地方设立营地，而反之则应将营地设在舰炮保护的范围内。
陆军己经先期做好了准备工作，而直到第二天下午，原昆明舰的最后一批舰员才到齐集合。
在华东政府成立以后，7艘穿越军舰仅仅只保留5艘作战军舰，两梄登陆舰长白山舰和补济舰太湖舰均被拆除，舰上的设备拆下来，一部份供华东政府使用，一部份留作5艘作战军舰的更换备件，舰员也是一部份转入其他工作，一部份到人民军海军中工作；而5艘作战军舰上的舰员则轮流保留1/3的值班留守人员，其余的人大部份都在海军里，也有少量转为行政工作人员。其中还有8名原舰员在天津工作，5名原舰员在济南工作。
从理论上来说，有1/3的舰员就可以开动军舰，而有2/3的舰员就可以基本保证军舰的战斗力了，但考虑到这一次执行的是远洋任务，时间较长，舰员们需要轮流休息，以确保良好的状态，因此军委还是决定，让昆明舰全员出航。而且不仅仅是舰员，就连原昆明舰的舰长，现任海军部部长尚晋峰也亲自出征，同时他还被任命为这次护侨任务的总指挥。