双方最终决定，给爪哇华人5个月的准备时间，完成华人工会的成立，以及在殖民政府中任职华人的产生，在10月份正式上任，开展工作。
最后华东政府又提出，在爪哇设立办事处，协调处理华东政府和爪哇华人，以及荷兰殖民政府的各项关系。这个要求也十分合理，荷兰殖民政府尽管不愿意，但也没有拒绝的理由。
就这样华东政府和荷兰殖民政府终于完成了谈判，最终签定了【巴达维亚条约】。华东政府不仅获得了650万英磅的赔款，而且是继郑和七下西洋之后，中国的势力第一次伸入东南亚地区，并且由至获得了广大南洋华侨的支持，其影响力极为深远，一直到若干年之后，再充份的显现出来。
当然，对英国政府来说避免了和华东政府彻底决裂，还可以全力遏制俄国的扩张，同时又暂时将华东政府的势力挡在东南亚之外，也不失为为可以接受的结果。虽然按照【巴达维亚条约】的规定，爪哇华人可以在政治上取得很大的权力，但从总体来看，仍然还是由荷兰殖民者在政府中占主导地位，华人仅仅只能提升自己在爪哇的地位，但并不能左右爪哇的局势，而且这是唯一的可行办法，其他的条件都无法令双方都满意，至于荷兰殖民政府无法再向过去那样随意压迫华人，则不是英国考虑的问题。
尽管华东政府仍然可以借助爪哇华人的力量，以扶植代理人的方式向东南亚扩张，但那至少也是数年以后的事情，而当前英国主要的目标还是遏制俄国的扩张。根据英国政府的判断，对俄战争将在未来一、二年内发生，而集中日本、华东政府的力量，加上英国在背后支持，击败俄国的可能性很大，既然不能击败俄国，也能极大的削弱俄国的力量，令其无法再在远东扩张，而英国则可以视对俄战争的结果，再来确定应对华东政府的战略，慢慢将华东政府的力量挤出东南亚。
这次爪哇危机中最大的输家自然是荷兰，而这次失败也促使荷兰政府痛下决心，大力的发展海军，加强战斗力，以保护自己的海外利益。
不过这些都是以后的事情了，虽然签定了【巴达维亚条约】，但人民军并没有马上离开爪哇，因为现在还有许多善后的事情需要处理，因此双方约定，人民军将还在爪哇停留一个月的时间，处理其他的事情。