百济被灭国之后，齐王李佑代表大唐皇帝陛下，对原百济臣民发布了安民政策，政策规定，百济全体国民享受唐朝国民待遇，在百济实行均田制，免税一年，减税三年，免除无偿劳役，得到了百姓尤其是广大基层百姓的拥护。
对于原百济扶余贵族，在百济灭国之战中有功者给予了奖励，授予唐朝相应的爵位。对于在土地改革中，按照规定交给国家的土地，朝廷也给与了他们相应的补偿。这样的政策，没有引起他们激烈的反对。
总之，唐朝宽和的政策稳定了原百济的局势，使其平稳地并入了大唐。
居拔城王宫。
武王扶余璋一家被送往长安后，百济王宫就成为了东征军东路(相对于李世民统帅的东征军西路)大帅府和百济总督府。
这天，百济总督府军政官员齐聚一堂，听取齐王李佑发布朝廷颁布的嘉奖和人事任命。
鉴于刘仁轨、司马炯、程处亮等人的优异表现，朝廷册封刘仁轨为蓝田县公，司马炯为百济侯，程处亮为居拔城侯，王珏为光州侯，海军陆战队王耀祖、乔斌，原登州军刘安进、沈明等四位军使都获得了贵族爵位。
百济总督府的主要官员是：
总督司马炯、副总督燕昌翰、长史原登州刺史姚东、司马程处亮等。
随后，齐王李佑发布了东征军东路军整编命令：
大帅李佑、副帅侯君集、张亮，下辖22万唐军陆军，5万海军。
命令宣布完毕，众人皆大欢喜。
接下来，东征军东路统帅部召开了整编后第一次作战会议。会议内容为东路军进军方向。
对于攻打百济，侯君集没有赶上，心中就有些窝火，他提前对高句丽进行了研究，已经有了进攻高句丽的成熟的作战方案。
他说道：“殿下，臣以为首先以海军封锁高句丽沿海海域，然后陆军兵分两路，一路从开城地区向西进攻，一路从大同江口登陆，两路大军直奔平壤。”
张亮等人也都研究了攻打高句丽的作战方案，大家都认为侯君集的意见既稳妥又有效，都表示赞成。
得到了众将的认可，侯君集很高兴，他问道：“殿下，您是什么意见？”
李佑说道：“陈国公不愧是我大唐顶尖的军事人才，制定的作战计划非常优秀。
不过，高句丽与百济不同，甚至与其它所有国家都不同，是一个极其难以对付的对手。
数百年来，高句丽无数次打败了中原王朝，就连唐军去年也遭到了挫折。在这种情况下，高句丽人心中有着强大的自信，对于唐军的进攻，他们会进行十分顽强的抵抗。
采用一般的战术，即使能够灭掉高句丽，唐军也会遭受重大的损失。而且，在这种情况下，打下高句丽，高句丽人也会死伤惨重，这些人的眷属会积累起对朝廷的极大仇恨。
这样的高句丽打下来就是个烂摊子，将来治理起来，难度会很大，会牵扯朝廷大量的精力。”
侯君集等人都是从军事上考虑的，听到李佑这么说，都认为有道理。
唐朝这么多年来，新增加的疆域如草原、西域、济州岛、波斯和baji斯坦，包括眼下的百济，都是在齐王殿下的统帅下完成的，众人对于他的权威性都十分认可。
张亮说道：“殿下，您说怎么打，臣等都听您的。”
侯君集的意见尽管受到了李佑的否决，可是他认为李佑一定有更好的主意。他说道：“是啊，殿下，您说怎么办，臣等一定服从您的将令。”