不过，这还没完。佐贺藩的支藩鹿岛藩和小城藩的两个锅岛家的分支族人，在接下来的两天，很快遭受佐贺藩兵的攻击。
与此同时，新任佐贺藩主锅岛玄瑞宣布，收回鹿岛藩和小城藩的支藩地位，建立独一无二的佐贺藩。
鹿岛藩和小城藩的锅岛支藩很快便被攻克。佐贺藩很快便统一起来，新任藩主锅岛玄瑞，也正式成为佐贺藩的主人。
其后，佐贺藩将自己辖地的两处划分了出来，新成立了两处小藩，上报给幕府。一处是将鹿岛封给久坂家，重建鹿岛藩，俸禄为五千石；一处是将武雄封给后藤家，建立武雄藩，俸禄为一万石。
没两天，德川幕府以难见的高效率批了下来，正式封锅岛玄瑞为佐贺藩藩主，而鹿岛藩和武雄藩也封了下来。
与此同时，停放在长崎码头的二大船布匹被卸了下来，转运送往德川幕府所在地，江户城。
锅岛玄瑞任藩主后，便开始追随罗森，进行了他的游学生涯。佐贺藩的藩事政务，都交给一名叫林鸿年的天朝之人打理。
紧接着，江户城又传出一个惊人的消息：德川幕府作出决定，将日本唯一的开放口岸长崎，全部划分到佐贺藩，交给佐贺藩打理。代价便是佐贺藩每年上缴100万石粮食给幕府。
日本的上百个大大小小的各藩国，纷纷猜测幕府为什么会作如此决定，最终分析倾向于德川幕府为了自身的名声和实际利益，才这样做。幕府一方面要加紧闭关锁国，但另一方面又舍不得长崎与外界的贸易，特别是中国贸易带来的关税和利润。于是，这样的决定便出现了。
长崎原本是由幕府直辖管理，不但收取来贸易的外国商人关税，还指定只能由江户方面指派的商人与之交易，这样一来，各地藩主对之很是眼馋，意见很大，纷纷表示要掺杂进来。幕府的压力也很大，无奈之下，德川幕府便想出了这么一出。当然，代价不是没有。
关税方面，降低了一半。而且，谁也不知道的是，前面的哪一系列动作，包括不但不追究佐贺藩主离奇死亡，藩位被夺等事情，都是付出的代价。
不过，幕府方面乐意，周围其他的藩国不愿意了。与佐贺藩最为接壤的筑前藩、筑后藩两藩便首先抗议，直接在九州岛最西南端的强藩摩萨藩的支持下，出兵上千，前往佐贺藩的边境陈兵，提出也要分些长崎港的利益。