而这时的洛阳，正在经历着一场血雨腥风。
原来在经历了李孝逸和张光辅的两场失败之后，武后终于意识到，想要保证己方取得胜利，一定要想办法清除掉隐藏在朝廷大军内部的那些李显亲信，所以，在侄子武三思的建议下，武后展开了大规模的清除奸党的行动，经过了将近两个月的蛰伏，武后终于祭起了屠刀，开始了大开杀戒。
武后在武三思等人的唆使下，再度起用之前宣称永不叙用的周兴、来俊臣等人，大兴冤狱，在短短数天的时间，就有无数的官员被投进了御史台的监狱之中，好在现任的御史大夫李昭德为人刚正，想办法保存了一些官员，不过仍然有不少的大臣“含冤”死在了狱中。
而这些死去的官员中，大部分竟然都是李唐的宗室，比如太尉、韩王李元嘉，开府仪同三司、滕王李元婴，太子太师、鲁王李灵夔，太子太保、纪王李慎、黄国公李撰、东莞郡公李融等等。
甚至武后还命人悄悄处死了正被关押在巴州的前太子李贤，原因据说是因为李贤听说李显被剥夺了大权之后作了一首黄台瓜辞，结果惹怒了武后，其实最主要的因素是武后担心一些人利用李贤的名义起兵造反，让她的政局更加无法安稳。
其实对于这些宗室成员，李显也并没有什么好感，因为这些人平日里仗着自己的身份，在地方上为所欲为，欺凌地方官员，甚至连皇帝都不怎么看在眼里，更兼手中掌控着兵权，就算武后不出手对付他们，将来他也会下手，现在正好借着武后的手来剪除这些力量，同时还能够利用这件事激起天下对武后的不满，可以说是一箭双雕的好计。
只不过李显可惜的是，被那越王李贞逃了回去，并且很快与他的儿子琅琊王李冲等人举兵起事，还打出了让李显交权的旗号，可是这李贞的做法和李敬业完全不同，竟然出兵攻占金陵，虽然表面上看是在策应李敬业，可是此人图谋不轨之心昭然若揭，明眼人一眼就能看出来，所以李显暗暗嘱托李敬业对越王李贞父子进行防备。
在这其中也有不少正直的官员遭到陷害，这其中也有不少是李显的人，然而在上官婉儿和韦团儿等人的暗中保护下，这些官员虽然受了一些苦，绝大部分却没有性命之忧，其中一些重要的成员还都被李显想办法通过借尸还魂、金蝉脱壳等妙计给秘密解救了出来。
然而在这其中也有李显无能为力的时候，比如太平公主的驸马薛绍。
其实薛绍本来与叛乱没有任何联系，然而在这时候武承嗣贪图太平公主的美色，暗中向武后献计，薛绍之前就与李显暗中勾结，现在在这时候还地位超然，并且采取不与武后合作的态度，十分的危险，应该想办法将薛绍给处死，然后让太平公主与武氏兄弟联姻，这样的话太平公主就真的是武后的人了，以太平公主的才能和宗室女的身份，完全可以消除天下人对于武后大杀李氏宗室的不满情绪，可谓是一举数得。
武后听了武承嗣的话，心中深以为然，于是指使已经被拜为御史中丞的来俊臣诬陷薛绍谋反，于是来俊臣便借口薛绍的兄长薛覬与琅琊王李冲有过书信来往为借口，指出薛覬参与谋反，同时又诬陷薛绍也参与其中，并且对薛绍进行严刑拷打，结果薛绍竟然“畏罪自杀”。