大蛇丸，一代天骄奇才，被三代目火影猿飞日斩誉为五十年才出一个的奇才，寄予厚望。·首·发事实上，大蛇丸也的确不负众望，成长速度极为迅速，即便是身为千手一族正统后裔的千手纲手与其相比都远远不及，更遑论是资质平庸的自来也。
第三次忍界大战，大蛇丸、自来也、纲手的三人小队大放异彩，所向披靡，威震天下。尤其是作为三人之首的大蛇丸，更是凌厉无论，不知道杀死了多少自命不凡的忍者！
最后，素有“半神”之称、与猿飞日斩一同站在忍界巅峰的山椒鱼半藏都给惊动了，亲自前来阻止。一场‘激’烈之下，“半神”山椒鱼半藏不负盛名，生生击败了年轻的三人，并且赋予了三人“木叶三忍”的名号。
这也是三忍名号的由来！
战后，大蛇丸深刻的认识到了自己实力的不足，想尽一切办法来提升自己的实力。他一边拼命刻苦的修行，一边进行研究调查，希望能够找到一条短时间内迅速提升实力的捷径。
大蛇丸最终是找到了方法。其一，学习禁术。所谓禁术，即是会消耗使用者大量‘精’力或者会对使用者造成极大伤害甚至死亡的忍术。虽然伤害‘性’极大，却也具有超强的破坏力，是短时间内增强实力的捷径之一。
其二，大蛇丸将目标瞄准了木叶第一强族宇智‘波’一族的血轮眼。
血轮眼，威震忍界的三大瞳术之一，为木叶最优秀的家族——宇智‘波’一族所拥有。它拥有极为强大的能力，可以看清人体内的查克拉脉络，看穿对手一切的细微动作以及结印，瞬间复制并看穿非血继限界的忍、体、幻三术，堪称是一种无敌的能力。
尤其是，血轮眼可以在瞬间复制非血继限界的任何忍术的能力，极大地吸引了大蛇丸的目光。
在大蛇丸眼中，所谓的忍者、强者，即是通晓一切忍术的人。只要拥有了血轮眼，他就可以在最短时间内学到所有的忍术，即刻提升自己的实力，而不用再每日里艰苦的修行。
大蛇丸是一个极为有野心的人，他采取了双管齐下的策略。一边进行各种各样禁术的学习与研究，一边对宇智‘波’一族内的年轻一代进行观察，企图从里面找出来一个优秀的人，他夺取血轮眼，从而达到自己的目的。
最后，大蛇丸选择了宇智‘波’一族这一代最优秀的一个年轻人，宇智‘波’鼬。只是，大蛇丸没有想到的是，他还没有对宇智‘波’鼬动手，他杀害同村忍者进行禁术研究的事情就被猿飞日斩发现了，仓狂逃窜。
在猿飞日斩手下留情，逃命能力又极强的大蛇丸狼狈的逃出了木叶，开始了一个人的生涯。一个很偶然的机会，他得悉了一个名为“晓”的组织，里面全部是由各个国家的s级叛忍组成的，强者如云。
为了摆脱木叶暗杀部队的‘骚’扰，并且拥有更多的机会和强者‘交’流，大蛇丸决定加入“晓”组织。大蛇丸怎么也没有想到，他在这个组织里面竟然见到了传说中的轮回眼，无论是威名还是能力都要远远胜过血轮眼的传说中“六道仙人”所拥有的眼睛！
大蛇丸震惊的同时，也对轮回眼的拥有者——“晓”组织的首领零进行了挑战，他非常迫切的想要证实一下这双传说中的“仙人之眼”是否是徒有虚名。
一战之下，大蛇丸遭遇到了人生中的第一次惨败，即便是败在山椒鱼半藏手中的那一次，也没有这一次悲惨。他被零仅仅五招就击败了！