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在神农氏将要退位的前一千年，西方教终于忍不住动手了，他们暗中沟通了刑天，直接派了蚩尤麾下的刺客去行刺姬轩辕。
在行刺姬轩辕一事上，他们做的很周密详细，两个分别传承了“空间”“时间”的大罗真仙境的巫人和一个精修“雷霆”大道的人族武者被他们用各种手段运作到了姬轩辕的守卫中，先是让传承了“雷电”的刺客作为诱饵给姬轩辕的肉身增添麻痹、中毒等负面影响，并使得他们放松警惕。之后让传承“空间”的刺客在混乱中再尝试给予致命一击，空间的诡秘起码可以给姬轩辕造成一个重要器官部位的破损。若是姬轩辕还是没有死亡的征兆，拥有“时间”传承的刺客会再补一刀并且使用时间加速的秘技确保姬轩辕身死轮回。
他们的计划不仅狠毒而且出人意料，在同一时间连续三次守卫出手行刺的情况下，姬轩辕真的几乎濒死要入了轮回，幸亏当时的神农氏在处理完各项事务后准备找姬轩辕劝说他将人皇之位让给蚩尤。也许是因为信奉的教义有所区别，身为截教弟子的神农氏一直不是特别喜欢姬轩辕。
所以在姬轩辕真的只剩下最后一口气的时候，神农氏出手将刺客杀死，还保住了姬轩辕的命，也真是“天意如此”。因为这件事情，神农氏只能是将心思放在治愈姬轩辕和调查真凶上，没有劝说姬轩辕放弃再向前一步争夺人皇之位的时间。
西方教和巫族因为心急失去了让蚩尤一步登天的机会，之后被查出各项龌龊的事情之后，蚩尤更是没有了成为人皇的机会。
这刺客一事虽然西方教和巫族都尽量抹除了蚩尤和他们的痕迹，可是不得不派遣的两个巫人还是让神农氏想起了当年收服九黎部落时心中的怀疑，神农氏有了怀疑的对象，调查起来就非常有效，只是花了些心思就有了许多可以作为蚩尤派遣刺客行刺姬轩辕的证据。
但是神农氏对于这种很是明显的事情却是不大相信，而且因为对蚩尤的观感一直不错，他决定继续暗中调查下去。
而在神农氏引而不发的调查阶段，西方教又驱使青丘狐族的王女去勾引姬轩辕，想要用美色来腐蚀他的心智。
姬轩辕在疗伤之后，途径涂山青丘为青丘狐族所邀请，去参加青丘狐族王女的成人礼。在宴会上被早就安排好一齐起哄的观礼众人所影响，莫名的对青丘狐族王女灵九产生了好感，又被灵九用青丘狐族祖传的媚术引诱最后以天为被，以地为床，共赴了巫山，“英雄难过美人关。”他终究是中招终日沉溺于美色之中。
而直至姬轩辕回复过来整整过了八百年的时间里，刑天、风伯和雨师终于造好了巫族祭坛，并强行打晕了蚩尤开始了唤醒前世记忆的仪式，不过也许是这一世人族的气运实在太过强大，蚩尤今生的意志竟然没有被前世所完全压倒，蚩尤出现了人格分裂的症状，刑天等人不得不用特殊的巫族法器将人族人格的释放时间调到子夜。
于是在白天拥有了巫族意志的蚩尤开始了人族朝堂的权臣生涯，姬轩辕一派的人马被他拉拢了三分之二，加上他自己本来的半壁江山，作为人皇的神农氏有些不利于巫族和九黎部落的政令都出不了首阳山。