皇朝六部，与皇朝的制度一样，已经有些跟不上飞速发展的生产力，尤其是正在筹备「弃教存法」改革，针对此事亦需腾出一些官职。
与其被动接招不如未雨绸缪。
过去——
刑部掌管刑狱，由蓐收担任执首，成员多为蓐收一脉或金属功体修行者，可视为苍皇直辖。
工部掌管锻造、建造与矿脉勘探、开采，成员多为太常与共工两脉，或者功体为土、水、火属性的修行者，由聂寒担任执首，共工担任工部侍郎，下辖阳渊火族与三清道界等势力。
户部掌管农业与食物制作以及凶兽育种、驯化，同时统筹户籍与对外贸易，包括土地以及税收亦受其管辖，成员多为祝融与奢龙两脉，或者功体为木、火、土属性修行者，并且对数算成绩有一定要求，祝融担任执首，奢龙担任侍郎，下辖西陵一族与海市龙灯等。
兵部由大鸿担任执首，岳云深担任侍郎。
礼部由夏戡玄担任执首，吟长霄担任侍郎。
吏部由……
总而言之，虽然各部都有下辖部门，来分担各方面的工作，防止管不过来被累死，但整体来说结构还是存在很大的问题。
在这样的前提下，有了皇朝这一次改制。
以「苍皇」为核心分出四个区块。
即御殿、御史台、皇辅院、鳌烛院，由这四个区块统筹整个轩辕皇朝。
其中，御史台由六相之一的剑谪仙担任「太御公」，日常对接苍皇，下设御史大公，御史大公之下则设有御史监察与御史校官，再下则是郎中、典录、舍人与监察使等。
鳌烛院取自「断鳌立极」之典故，鳌之四足足以支撑天地，是轩辕皇朝一大支柱，负责管理皇朝各项超级工程，比如大罗天、守藏阁、典史宫、周天星斗大阵等等。
鳌烛院设院主，下设辅宫，辅宫下便是钦天监、守藏阁、典史宫、太上府等。
它的管理机构囊括主管、副官、文书、监督、维护、采购。
监督由御史台外派，维护人员鳌烛院自己出一部分，工部外派一部分。
皇辅院由轩辕旧部组成，也就是祝融等人退下来后皆入此院，下辖户部与刑部，设尚书、尚书下设郎中，郎中下设典录、郎公、舍人以及监察使；宗正府亦是皇甫院下级部门，主要管理宗室与外戚，原本负责的外交事宜已移交礼部。
最后便是御殿，轩辕六相除了太御公，其余五者皆被它囊括。
司空下辖吏部与集贤府，吏部设尚书，尚书下设吏部郎中，郎中下设吏部典录、吏部郎公、吏部舍人与吏部监察使；集贤府设督府，督府下设集贤府郎中，郎中下设集贤监察使、集贤官、集贤舍人。
司徒下辖礼部与太学都府，整体构架部参照部、府参照府。
司马下辖兵部与军校府，太医令下辖理部与科工府，太巨子下辖工部与外工府。
尚书与督府平级，是一部、一府长官；
郎中与府郎中平级，是一部、一府副手；
部典录与府官平级，负责文书工作；