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就在柯南想着组织的事情时，有人打来了电话，从小兰接电话的言语中听到，是有一位软体工程师失踪了，对方要过来事务所，委托毛利小五郎调查一下。
失踪的工程师叫板仓卓，找他的人则是分别来自三个公司的人，他们都有项目和板仓卓合作，而且截交的时间快要到了他们却联系不上人了。
原本柯南以为只是一个普通的失踪事件，没想到在询问详细情况时，有人提到了疑似斯米诺和龙舌兰的人引起了柯南的注意。
【“这个板仓卓，该不会是开头的那个看不到脸的人吧？
那不用找了，已经嘎了。
组织干的？斯米诺杀的？
感觉不像，组织做事应该不会让其他人轻易发现吧？】
柯南几人根据委托人提供的线索找到了板仓卓住的酒店，但是却发现人已经死了。
【“这么一看，凶手看来和组织无关了。
经典三选一来了。
所以，组织的人合作对象被杀了，那他会不会留下什么线索？
别担心，柯南会出手。
警察来了。
我看到了谁，是景光猫猫啊！
诸伏警官！”】
陆向熙直接跳过破案过程，凶手相马龙介认罪，这时候酒店房间的电话响起。
“我不在家，请在滴声后留言，滴——”
电话里响起一个清冷的声音：“板仓先生，软体截交时间要到了哦，请您务必遵守时间。”
柯南听到电话里的声音，表情惊恐。而诸伏警官神情严肃，用极低的声音说了一个名字：“斯米诺……”
这立刻引起了柯南的注意，但是诸伏景光却含糊了过去，一副不想多说的样子。
【“他好有礼貌，甚至说请。
组织的人好像只有斯米诺这么礼貌吧？哈哈哈！
种花家乃礼仪之邦。
所以，组织还不知道板仓卓已经死了？那柯南又有可操控空间了。】
画面一转，在昏暗的房间里，一个人影坐在沙发上，镜头只给出了半张脸，阴影颇重，极其凸显反派气质。那双红褐色的瞳孔仿佛能穿透画面看过去。
“呐，好熟悉的声音啊……”一只手从耳朵里摘下耳机放到桌面，修长漂亮的手指轻轻敲打着桌面，语气略带兴奋，“这不是绿川前辈吗？我终于……找到你了。”
【“瑟瑟发抖中。
所以……板仓卓住的地方有窃听器？斯米诺一直都听着呢！
那不是完了？他们岂不是已经知道板仓卓死了？
可是软体他们还没拿到吧？怎么办？
难道就我注意到了，斯米诺说的‘绿川前辈’？该不会指的是景光吧？
所以，景光还有什么神秘身份！！
对不起，我真的觉得，斯米诺叫前辈，好涩涩。
同上，我也想被叫前辈。
嗯？楼怎么歪了？但是我也想。
拿着枪一边怼着你脑袋，一边叫你前辈的那种吗？
是一边把我踩在地上一边喊我前辈的那种。
咦，前面的，请穿上裤子。”】
总有bt图谋不轨，陆向熙心想。
案件结束，柯南带着从板仓卓家里拿走的日记磁盘去了阿笠博士家查看。
日记内，唯一提到的只有一个黑衣服的女人去找过板仓卓，后面就再也没提到过关于组织的内容。
“奇怪，这个板仓先生做事也太粗心了，格式空这么大一片……”
阿笠博士的话令柯南恍然大悟，他用鼠标一拉，显示出了空白处的文字。
“这是……”
柯南在日记里看到了关于板仓卓被组织威胁的全过程，日记里提到了年轻的黑衣男人、黑衣女人以及后期在电话里联络板仓卓的女人，柯南只能确定年轻男人应该就是斯米诺。
后面就是关于板仓卓意识到了软体的问题，打算在交易之前逃离出国，日记写出了软体被藏在哪里还有最后的交易时间。
不巧，就是今天晚上九点。
柯南当即决定前往群马县去拿软体，希望借此引出组织的人获得更多的信息。
【“胆子贼拉大。
就是一个字，勇！
但是，斯米诺已经知道了板仓卓死了，他们肯定也会想办法拿到软体的。组织还不知道软体被藏在群马县吧？