在原本的封建皇朝中，六部每部各辖四司，共为二十四司。但是刘厚仿照了后世的部分部委结构，加了很多个司进去，这使得每个部不再仅限于四个司，有些部的司少，是个位数，有些部的司则多达两位数，具体看各部分管的事项多少，没有一定的定数。
这样的例子很多，除了上述的宣传部外，再例如，在原本的封建王朝，对于商业是很看不起的，所以不可能像后世那样，设立一个商务部去促进商业发展，但是刘厚决心大力发展商业，就设立了一个商务司，挂在了户部下面。
而像后世的水利部、交通部等部门，也统统变成一个司，被挂在工部下面。还有环境保护这样的部门，在原本的封建皇朝也是没有的，刘厚同样设立了一个司级单位，挂在刑部下面。
这个举动让新上任的环境保护司各级官吏都莫名其妙，不知道自己这个部门是干什么活的，而其他人则是对于这个司放在刑部感到难以理解，不知道环境保护和刑罚有什么联系。
这样的例子比比皆是，总的来说，刘厚和陈群搞的这个三省六部制和原封建皇朝的三省六部制并不一样，刘厚只是借壳一用而已。
这个新的六部其实更像后世的部委，只不过是采用了大部委制，将原来共和国的几十个部委，全部降级为司级单位，然后分门别类塞到六个部里面去。
说完六部就要说三省了，三省六部制中的三省是指中书省、门下省、尚书省。六部其实是尚书省下属的吏部、户部、礼部、兵部、刑部、工部。在中央行政机关设立三省，目的在于分割和限制尚书省的权力。
中书省是最高决策机构，负责草拟和颁发皇帝的诏令。由于刘厚比较喜欢内阁这个名字，所以，他就把中书省改称为内阁，这等于是整个天朝的大脑，所以，阁臣都是由诸葛亮这些智谋深远的人来担任。
政令制定出来后还不能马上执行，需要先交给门下省审核。门下省是审议机构，负责审核政令。门下省与中书省同掌机要，共议国政，并负责审查诏令，签署章奏，有封驳之权。其长官称侍中，也可以称为左相，可见其权力也是极大的。
如果门下和中书两个机构的大佬不和，很容易造成扯皮不清，导致行政效率低下。例如，如果门下省的侍中对内阁某阁臣有意见，想公报私仇，那他可以将内阁制定出来的政令封驳回去，使得这道政令无法出~台。
当然，门下省也不可能顺便捣乱，要封驳政令也得有理有据才行，如果他经常乱来的话，皇帝肯定会换人来做。
门下省侍中由蒋琬担任，蒋琬是刘备时期的旧臣，对刘氏忠心耿耿，也有宰相之才，由他担任这个左相再适合不过。让他担任这个位置还有个原因，那就是他和诸葛亮的关系很不错。
蒋琬曾经因不理政事激怒刘备，刘备一怒之下要杀他，后来在诸葛亮的劝说下，蒋琬才免于一死。再之后他重新被启用，诸葛亮又将其悉心培养，并且还暗中对刘厚说过，这个蒋琬可以作为自己的接班人。
可以说，诸葛亮对蒋琬有救命之恩加知遇之恩。这样的关系可以令两个部门不至于互相推诿扯皮，提高行政效率。当然，两个互相制约的部门大佬关系太密切的话，也会带来一个不好的结果：两个部门串通起来图谋不轨。