下设南、北两院，九处三卫。
南、北两院：分管大周王朝南北两境事务，机构组成密不外露。
九处：内察朝廷百官，外理四方要务，各司其职，体系完备。
三卫：监察司专设卫军，分为黑、青、赤三色，纪律严明，战力高深不可测。
监察司内，无品无阶。
天、地、玄、黄四字号令，可为身份辨别之物。
通政司：
通政使（正三品），左、右通政（正四品），左、右参议（正五品），经历（正七品），知事（正八品），通政司监察使（无品阶，隶属于监察司）
掌管出纳帝命，通达下情，勘合关防公文，奏报四方臣民实封建言、陈情申诉及军情、灾异之事，广开天下言路。
通政使：掌管受理内外章疏、敷奏封驳之事。
左、右通政：受理内外章疏和臣民密封中诉之件。
左、右参议：辅佐通政使，受理四方章奏。
经历：掌收发文移及用印。
知事：掌收发上下文移。
翰林院：
翰林学士（正一品）、侍读学士（从五品）、侍讲学士（从五品）、侍读（正六品）、侍讲（正六品）、史官修撰（从六品）、编修（正七品）、检讨（从七品）、五经博士（正八品）、典籍（从八品）、侍书（正九品）、待诏（从九品）、翰林监察使（无品阶，隶属于监察司）
职责：
一、充经筵日讲：每年秋天举行经筵典礼。
二、掌进士“朝考”之事：每科于“殿试传胪”后，礼部以新进士名册送翰林院，由掌院学士奏请“御试”。
三、论撰文史。
四、稽查史书、录书。
五、稽查官学功课。
六、稽查理藩院档案。
七、入值侍班。
八、科举监考。
翰林院下设：典簿厅、待诏厅。
典簿厅：掌管奏章、文移及吏员、差役的管理事务，并保管图书。
待诏厅：掌管缮写、校勘之事。
国子监：
祭酒（从四品）、司业（正六品）、监丞（正八品）、五经博士（从八品）、助教（从八品）、典簿（从八品）、学正（正九品）、学录（从九品）、典籍（从九品）、教授（从九品）
另设有衍圣公（正二品），由历代文圣兼任。
大周王朝教育管理机关与最高学府，与四大书院比肩而立。